合肥综合保税区自2015年6月29日封关运行以来，审结进出口报关单97473份，进出口总值达21.7亿美元。今年1月至5月，合肥综保区进出口总值5.19亿美元，同比增长64.8%。
合肥综保区内目前共有晶合集成电路、新汇成微电子、视崖显示、奕斯伟材料等25家企业，总投资249亿元人民币，涵盖集成电路、半导体、液晶面板整机等新兴产业领域。合肥海关根据区内企业实际需求，对符合条件的企业采取“批次进出、集中申报”的报关模式，同时针对集成电路企业的生产需求的特殊性，对高资信企业开展“7×24小时”系统自动审批;对境内出入综保区不涉税、不涉证、不要求退税且不纳入海关统计的货物、物品实施便捷进出区管理模式;支持综保区区内企业利用剩余产能承接境内区外委托加工业务;积极探索开展“融资租赁”“先出区、后报关”模式，提高海关通关便利化水平。
今年1月，《国务院关于促进综合保税区高水平开放高质量发展的若干意见》出台，提出21项具体便利举措，合肥海关及时积极组织开展政策宣讲，引导企业用好用足改革举措。